UNHCR w Polsce współpracuje z siostrzanymi organizacjami ONZ m.in. Ośrodkiem Informacji ONZ (Biuro UNIC w Warszawie) oraz Światową Organizacją Zdrowia (Biuro WHO w Polsce). Współpraca ta również obejmuje Biuro Projektowe Programu Narodów Zjednoczonych ds. Rozwoju (UNDP), Polski Komitet ds. UNESCO oraz Polski Komitet Narodowy UNICEF. Jednym z najważniejszych partnerów UNHCR jest Międzynarodowa Organizacja ds. Migracji (IOM) działającą w Polsce od 2002 r.
Koordynacja działań w ramach systemu Zespołów Krajowych (UN Country Team) obejmuje wszystkie organizacje Narodów Zjednoczonych, podejmujące działania na rzecz rozwoju, niezależnie od ich formalnej obecności w danym kraju. Celem systemu koordynacji jest stworzenie platformy współdziałania dla poszczególnych instytucji systemu ONZ, tak aby zwiększyć skuteczność i efektywność ich działań na poziomie krajowym.
Więcej informacji na temat ONZ w Polsce znajuje się na stronie Ośrodka Informacji ONZ www.un.org.pl