Głównym celem UNHCR w Europie Środkowej jest zapewnienie wszystkim osobom ubiegającym się o status uchodźcy dostępu do bezpiecznego terytorium oraz sprawiedliwych i skutecznych procedur azylowych. W związku z powyższym agenda wprowadziła projekty zarządzania granicą w sześciu krajach regionu: Bułgarii, Polsce, Rumunii, Słowenii, na Słowacji i Węgrzech. Projekty te oparte są na umowach trójstronnych pomiędzy władzami rządowymi, organizacjami pozarządowymi w danym kraju i UNHCR.
W ramach projektu uczestniczące w nim organizacje pozarządowe, jako partnerzy odpowiedzialni za jego wdrożenie, regularnie odwiedzają przejścia graniczne i ośrodki zamknięte, aby ocenić dostęp osób ubiegających się o status uchodźcy do terytorium i procedur azylowych. Rozmawiają z nowo przybyłymi, sprawdzają ich akta i dostarczają informacji na temat ochrony oraz porad prawnych. Po wizycie przekazują raport z niej UNHCR i straży granicznej oraz opracowują raporty oceniające. Kwestie poruszone w raportach stanowią przedmiot regularnych posiedzeń grup roboczych, a także spotkań doraźnych organizowanych, gdy potrzebne jest natychmiastowe działanie.
Projekty zarządzania granicą obejmują również szkolenia dla straży granicznej i organizacji pozarządowych, aby zapewnić lepsze rozumienie kwestii uchodźczych i azylu, osób szczególnie narażonych i o szczególnych potrzebach. Ponadto w kluczowych miejscach wzdłuż granicy zewnętrznej umieszczono kilkaset stojaków z ulotkami w różnych językach, z informacją dla nowoprzybyłych o ich prawie do ubiegania się o status uchodźcy, a także danymi kontaktowymi lokalnych organizacji udzielających pomocy prawnej.
Na przestrzeni lat projekty zarządzania granicą i ochrony uchodźców przyczyniły się do poprawy dostępu do terytorium oraz procedur azylowych w sześciu krajach Europy Środkowej. Wzmocniły współpracę pomiędzy strażą graniczną a organami migracyjnymi i azylowymi, ale również pomiędzy rządem, organizacjami pozarządowymi i UNHCR.
Projekty te pomogły także ustalić potrzeby szkoleniowe, a UNHCR mogło przeprowadzić setki sesji szkoleniowych dla straży granicznej oraz pracowników ośrodków zamkniętych i recepcyjnych. Projekty te doprowadziły również do zmian w istniejących przepisach prawnych, w szczególności w zakresie zasady non-refoulement, kamienia węgielnego międzynarodowej ochrony uchodźców, jak i niepenalizacji wjazdu.
