Niektórzy uchodźcy nie mogą powrócić do domu, bo obawiają się, że narażeni byliby ponownie na prześladowania. Jednocześnie zdarza się, że w krajach, które udzieliły im schronienia też nie czują się bezpiecznie albo mają poczucie, że ich potrzeby nie są zaspokajane.
W takich sytuacjach, UNHCR pomaga przesiedlić uchodźców do kraju trzeciego. W skali globalnej takie rozwiązanie dotyczny około jednego procenta uchodźców. Kraj przesiedlenia zapewnia uchodźcy prawną i fizyczną ochronę, w tym dostęp do praw cywilnych, politycznych, ekonomicznych, społecznych i kulturowych podobnych do tych, które przysługują obywatelom tego kraju. Uchodźcy powinni mieć też możliwość ubiegania się po jakimś czasie o obywatelstwo tego kraju.
Przesiedlenie jest doświadczeniem, które zmienia całe życie. Przynosi zarówno wiele trudności, jak i korzyści. Uchodźcy są często przesiedlani do państw, gdzie społeczeństwo, język i kultura są dla nich całkowicie odmienne i nowe. Zapewnienie im skutecznej recepcji i integracji przynosi korzyści zarówno przesiedlonemu uchodźcy, jak i państwu przyjmującemu. Rządy oraz organizacje pozarządowe prowadzą działania ułatwiające ich integrację, takie jak programy wprowadzające do kultury, szkolenia językowe i zawodowe, jak również programy promujące dostęp do edukacji i zatrudnienia.
Obecnie jedynie niewielka liczna państw bierze udział w programach przesiedleniowych UNHCR. Stany Zjednoczone to największy kraj przesiedleniowy na świecie. Australia, Kanada i kraje skandynawskie również przyjmują sporą liczbę osób przesiedlanych każdego roku. W ostatnich latach wzrosła liczba państw biorących udział w przesiedleniach w Europie i Ameryce Łacińskiej.
W siedmiu krajach podlegających Przedstawicielstwu Regionalnemu UNHCR na Europę Środkową zaleca się tworzenie niewielkich programów przesiedleniowych. Niektóre państwa regionu podjęły pierwsze kroki w kierunku realizacji tego celu.
Rumunia i Słowacja stworzyły ewakuacyjne centra tranzytowe, w miejscowości Timisoara (Rumunia) oraz Humenne (Słowacja), gdzie ewakuowani są uchodźcy narażeni na poważne niebezpieczeństwo w kraju, w którym wcześniej znaleźli schronienie. Podczas przeprowadzania procesu przesiedlenia ośrodki te dają im szansę na życie w bezpiecznych warunkach w miejscu, gdzie dostępne są dla nich różne świadczenia i pomoc. Ponadto ośrodki stanowią dla państw przesiedleniowych miejsce do przeprowadzania procedury przesiedleniowej, w tym rozmów, kursów językowych oraz programów wprowadzające do kultury.
Te dwa centra są współfinansowane przez UNHCR, które doradza również w zakresie ich zarządzania i w kwestii ochrony.
Przedstawicielstwo Regionalne UNHCR na Europę Środkową uczestniczy również w projekcie EUREMA, w którym uznani uchodźcy są przesiedlani z Malty do innych Państw Członkowskich UE.