وقعت المفوضية مذكرة تفاهم مع الصندوق الكويتي للتنمية الاقتصادية العربية في عام 2016، وهو يعد شريكاً استراتيجياً يركز غالباً على مشاريع البنية التحتية. وقد قدم الصندوق دعماً حيوياً لمشاريع المفوضية في العراق والأردن واليمن، بمساهمات إجمالية قدرها 16.5 مليون دولار أمريكي لتحسين الظروف المعيشية للنازحين داخلياً واللاجئين وطالبي اللجوء، من خلال مشاريع المأوى وتوسيع خدمات المياه وتركيب الطاقة الشمسية وتوفير الخدمات الصحية.
